En un portal Joomla, si quieres integrar aplicaciones de terceros, como Coppermine, foros, etc, hay que canonicalizar la url, si no, es imposible que la validación de usuario funcione bien entre aplicaciones. Así que de nuevo gracias por el aporte!

Sino se me ocurre algo tan sencillo como poner un rel=nofollow en el enlace de cerrar sesión. Por lo que me cuentas con esto bastará.

Saludos

Saludos y gracias

- Canonicaliza el host: de www .example.com/loquesa a example.com/loquesea y viceversa.
- Canonicaliza el path: de host/loquesea/index.php a host/loquesa/. Por supuesto también de host/index.php a host/

< ?php
$target_host = "www .example.com"; // www .example.com or example.com
$redirect = false;
$path = $_SERVER['REQUEST_URI'];
$host = $_SERVER['HTTP_HOST'];

// Checking host
if ($host != $target_host) {
    $redirect = true;
    $host = $target_host;
}
$url = $host.$path;

// Checking path
$pattern = "^(.*)(/index\.php)$^";
preg_match_all($pattern, $url, $match);
if ($match[0][0] != "") {
    $redirect = true;
    $url = $match[1][0] . "/";
}

// Redirect
if ($redirect){
    header('HTTP/1.1 301 Moved Permanently');
    header('Location: http ://'.$url);
}
?>

Pero si también se quiere contemplar el caso de http ://www.ejemplo.com/index.php o http ://ejemplo.com/index.php se redirija a http ://www.ejemplo.com/ hay que poner alguna cosa más. Así que he modificado un poco este código con lo que el resultado ha sido éste:

$redirect = false;
$path = $_SERVER['REQUEST_URI'];
$url = $_SERVER['HTTP_HOST'];
if ($url != 'www.ejemplo.com' || $path == '/index.php') {
$redirect = true;
}

if ($redirect==true){
header('HTTP/1.1 301 Moved Permanently');
if ($path == "/index.php") {
header('Location: http ://www.ejemplo.com');
} else {
header('Location: http ://www.ejemplo.com' .$path);
}
}

¡Espero que os sirva!